大连民族大学环境与资源学院, 大连, 116600
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 8 篇
收稿日期: 2018年10月26日 接受日期: 2018年11月01日 发表日期: 2020年02月16日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 8 篇
收稿日期: 2018年10月26日 接受日期: 2018年11月01日 发表日期: 2020年02月16日
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摘要
1,3,4- 三磷酸肌醇 5/6 激酶(ITPK)作为磷脂酰肌醇信号通路的一种重要的调控酶,在动物、植物、线虫的生物信号传导和生长发育中起到重要作用。为了进一步对毛果杨中 ITPK 家族基因进行系统分析,利用毛果杨的基因组数据库,通过生物信息学方法,对毛果杨 ITPK 基因家族的基因结构、染色体位置、蛋白结构域、细胞定位预测、系统进化、基因表达进行了分析。结果表明:毛果杨中的 ITPK 家族基因共有 6 个成员,分布于毛果杨的 6 条染色上。进化树分析显示毛果杨 ITPK 基因可分为 3 个亚家族;基于保守域分析显示,PtITPK1~PtITPK5 均含有 3 个保守结构域,tITPK6 只含有 2 个保守结构域;毛果杨 ITPK 基因在各个器官或组织中均有表达。研究结果为进一步克隆该家族基因与验证 ITPK 家族基因与生物逆境胁迫相关提供科学依据
关键词
毛果杨(Populus trichocarpa); 1;3;4- 三磷酸肌醇 5/6 激酶(ITPK); 生物信息学分析
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